Bon j'essaie mais sans garantie.
Je pense que c'est des bulles de gaz (en fait je vois pas trop argumenter une origine liquide). Ce serait donc le résultat d'un dégazage assez tardif, dans la coulée.
Là, je sèche. Je n'ai jamais trop bien compris comment faire circuler des fluides à travers un basalte bien cristallisé se rendre dans des bulles de gaz, donc j'irais volontiers dans ton sens, fluide résiduel présent dans les bulles.
Pour la différence agate, cristaux, peut être est-ce lié à une vitesse de cristallisation différente, mais à mon avis il n'y a pas que ça.
Bon, il est clair que pour les améthystes type "Rio Grande do Sul" (Brésil, Urugay), les deux gisements que je connais sont dans des basaltes (Idar Oberstein en Allemagne, voir photo ci-dessous, la première trouvée (très fier), la seconde achetée), c'est peut être le gisement évoqué par Nico. Il me semble que j'en vu aussi en Namibie.
Pour les zéolites, entre Espalion en France et Poona en Inde, c'est aussi dans des basaltes, par contre les lithophyses sont dans des rhyolites
Pour la 6, c'est une excellente question, aucune idée.
Je passe la main, à vous Mesdames et Messieurs
Amitiés, Serge