D'après la définition dans le dictionnaire de géologie (Foucault et Raoult, 6ème édition) : Un oncolithe est un 'oncoïde formé dans des eaux
marines ou lacustres par encroûtement stromatolitique, autour d’un débris (nucléus), de couches concentriques algaires (algues bleues ou vertes)' et à oncoïde 'Concrétion calcaire, sphérique ou ovoïde, formée de couches concentriques, de quelques millimètres à quelques centimètres de diamètre, d’origine organique (algues, foraminifères, ...) ou non'.
Ce sont donc des structures d'origine biochimique, pouvant par exemple contenir des fossiles comme nucléus