Il faut dégager le calcaire à l'acide chlorhydrique, environ 30% (attention à la solubilité de la pyrite dans l'acide chlorhydrique). Toujours bien neutraliser l'acide avec de l'eau distillée ou de pluie additionnée de bicarbonate, ou eau du robinet dans le pire des cas.
Même s'ils sont trouvés propres il faut faire tremper les échantillons dans une solution de bicarbonate de sodium après avoir délogé le calcaire et impureté grace à l'acide. Sécher rapidement les échantillons (au sèche-cheveux par exemple). Ces échantillons s'oxydent facilement à l'air et sont à conserver en milieu sec.