Dans la littérature scientifique, on évite de parler de minéraux primaires ou secondaires ou alors uniquement dans le cas d'une chronologie relative clairement définie. Par exemple dans le cas d'une formation magmatique/hydrothermale, les minéraux primaires seront les minéraux magmatiques. Les minéraux hydrothermaux, formés durant l'altération des minéraux magmatiques (par exemple un greisen), seront les secondaires. Maintenant si on imagine en plus un stade d'altération météoritique, par exemple une kaolinisation, on va altérer les minéraux hydrothermaux du greisen par d'autre minéraux hydrothermaux formés à encore plus basse température via l'infiltration de l'eau de pluie (ceux-là sont plus secondaires que les secondaires eux-mêmes 🙃). Et cela peut-être ainsi pendant différentes étapes successives. La paragenèse de la roche enregistre de très nombreux stades de formations des minéraux. Donc il vaut mieux définir les minéraux par certaines de leurs caractéristiques (magmatique ou hydrothermal, température du fluide, type d'altération, etc) plutôt que par les termes primaires ou secondaires qui veulent dire des choses différentes pour chaque type de formation.