Salut, le focus stacking consiste à compiler les zones nettes de plusieurs clichés, il y a le logiciel Combine Z qui fait ça bien. Ca peut régler ton soucis, non ?
Concernant l'éclairage, en réalité la couleur de ta lumière importe peu si tu fais une balance des blancs correcte sur l'apn, pour ça tu peux utiliser des cartes de couleurs (blanc, noir, gris), l'étalonnage se fait soit avec le boitier soit en post traitement (il y a des tutos sur internet).
Un exemple par l'image trouvé sur le web (pour le focus stacking)
A+